Родилась в 1981 году в Свердловске (сегодня Екатеринбург). Окончила Уральский федеральный университет, затем прошла программу «Менеджмент культуры» в петербургском Институте «ПроАрте» и программу «Социология искусства» в Институте социологии РАН в Москве.
С 2002 по 2008 год была главным редактором журнала ZAART, а с 2005 по 2016 год руководила Уральским филиалом Государственного центра современного искусства. В 2013 году курировала запуск проекта Домов новой культуры в Первоуральске. В 2017 году возглавила дирекцию регионального развития РОСИЗО, а после передачи филиалов ГЦСИ Государственному музею изобразительных искусств имени А. С. Пушкина стала руководителем стратегических проектов музея. В 2022 году перешла в фонд V-A-C и Дом культуры «ГЭС-2» на должность программного директора, одновременно оставаясь комиссаром и художественным руководителем Уральской индустриальной биеннале. Покидает пост программного директора в декабре 2026 года, с 2027 года продолжит работать с «ГЭС-2» как приглашенный куратор отдельных проектов.
Как куратор работала над выставками и фестивалями в России и за рубежом, в том числе в Берлине, Нью-Йорке и Хельсинки. Среди проектов: «IN TRANSITION RUSSIA 2008» (Екатеринбург и Москва, 2008), «Product Placement» (1-я Московская биеннале молодого искусства, Москва, 2008), «ART on SITE / Искусство места» (Екатеринбург и Москва, 2008 и 2009), «Арт-завод» (международный фестиваль, Екатеринбург, 2008 и 2009), «Внутренний Урал» (в составе кураторского коллектива, Москва, Пермь, Санкт-Петербург и Екатеринбург, 2009), «Тонкая линия: аллегории возвышенного и брутального в российском видеоарте» (2009), видеопрограмма для SCOPE Art Show (Нью-Йорк, 2009), специальные проекты 1-й Уральской индустриальной биеннале (Екатеринбург, 2010), «Технологии в фокусе искусства: очарование и вызов» (выставка и форум ИННОПРОМ, Екатеринбург, 2011, директор проекта), «Город-порт: здесь моря нет» (4-я Московская биеннале современного искусства, Москва, 2011), «Современное искусство в традиционном музее» (13-й международный фестиваль, совместно с Еленой Коловской, Санкт-Петербург, 2015). Была комиссаром Уральской индустриальной биеннале в 2012, 2014, 2017, 2019 и 2021 годах и комиссаром проекта межрегионального развития NEMOSKVA в 2018 году, а также куратором сопутствующих ему событий.
3-я Уральская индустриальная биеннале и фестиваль «Современное искусство в традиционном музее» вошли в шорт-лист XI премии «Инновация» в номинации «Региональный проект современного искусства». 4-я Уральская индустриальная биеннале получила на премии «Инновация» 2018 года звание «Проект года». С 2006 по 2012 год Прудникова была экспертом, а в 2009 и 2011 годах входила в жюри первой российской национальной премии в области современного искусства «Инновация». Организовала и приняла участие более чем в сорока межрегиональных и международных конференциях, участвовала в программах HESP: «Alternative Culture» (с 2006 по 2009 год), «Teaching the Spatial Turn: Critical Concepts for a Globalizing World» (с 2010 по 2012 год) и «1st World Biennial Forum» (2012). Состоит в Ассоциации искусствоведов, Всемирной биеннальной ассоциации (IBA), Совете по культуре губернатора Свердловской области и Общественном совете Министерства культуры Российской Федерации.